Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCSO14618 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCSO14618 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCSO14618 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCSO14618 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCSO14618 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCSO14618 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCSO14618 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCSO14618 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCSO14618 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms