Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
UTP11Q9Y3A2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
UTP11Q9Y3A2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UTP11Q9Y3A2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTP11Q9Y3A2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms