Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COLQQ9Y215 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COLQQ9Y215 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLQQ9Y215 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COLQQ9Y215 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms