Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BATF3Q9NR55 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BATF3Q9NR55 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BATF3Q9NR55 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms