Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCCC2Q9HCC0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCCC2Q9HCC0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCC2Q9HCC0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms