Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
VCX3BQ9H321 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VCX3BQ9H321 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCX3BQ9H321 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms