Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THSD7BQ9C0I4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THSD7BQ9C0I4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THSD7BQ9C0I4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
THSD7BQ9C0I4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
THSD7BQ9C0I4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms