Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM3Q9BZL3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM3Q9BZL3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM3Q9BZL3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms