Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSRP1Q9BUV0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSRP1Q9BUV0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RSRP1Q9BUV0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RSRP1Q9BUV0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms