Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERP44Q9BS26 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERP44Q9BS26 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP44Q9BS26 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms