Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL3Q99963 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL3Q99963 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL3Q99963 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms