Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ALS2Q96Q42 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ALS2Q96Q42 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ALS2Q96Q42 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALS2Q96Q42 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms