Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNPC3Q96LT9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNPC3Q96LT9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNPC3Q96LT9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms