Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP47Q96K76 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP47Q96K76 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
USP47Q96K76 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
USP47Q96K76 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP47Q96K76 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms