Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3LQ92901 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL3LQ92901 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3LQ92901 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms