Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM239Q8WW34 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM239Q8WW34 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms