Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKA2Q8WVK7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SKA2Q8WVK7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKA2Q8WVK7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms