Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP9Q8IXQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP9Q8IXQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms