Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSTM4Q8IW00 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VSTM4Q8IW00 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSTM4Q8IW00 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM4Q8IW00 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms