Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms