Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXF1

TMEM108, Transmembrane protein 108, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM108Q6UXF1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM108Q6UXF1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM108Q6UXF1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM108Q6UXF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM108Q6UXF1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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