Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC39A4Q6P5W5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC39A4Q6P5W5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC39A4Q6P5W5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC39A4Q6P5W5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms