Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PXDC1Q5TGL8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PXDC1Q5TGL8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms