Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFT2D3Q587I9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFT2D3Q587I9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFT2D3Q587I9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms