Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf17Q53FE4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4orf17Q53FE4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf17Q53FE4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf17Q53FE4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms