Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC38Q502W7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC38Q502W7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms