Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU2Q2VPK5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTU2Q2VPK5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU2Q2VPK5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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