Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COL24A1Q17RW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
COL24A1Q17RW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
COL24A1Q17RW2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
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