Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHI3L2Q15782 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHI3L2Q15782 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L2Q15782 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L2Q15782 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L2Q15782 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L2Q15782 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L2Q15782 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L2Q15782 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L2Q15782 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L2Q15782 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHI3L2Q15782 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHI3L2Q15782 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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