Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
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