Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 LRPPRC-204ENST00000419884 888 ntTSL 55.2□□□□□ -1.582e-13■■■■■ 27.5
NOLC1Q14978 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.318e-12■■■■■ 27.5
NOLC1Q14978 AC010132.3-202ENST00000433579 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 225.03■■□□□ 1.67e-8■■■■■ 27.4
NOLC1Q14978 PSMA2-201ENST00000223321 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 27.4
NOLC1Q14978 PSMA2-203ENST00000436986 1453 ntTSL 310.35□□□□□ -0.757e-8■■■■■ 27.4
NOLC1Q14978 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.957e-8■■■■■ 27.4
NOLC1Q14978 PSMA2-205ENST00000457444 801 ntTSL 39.09□□□□□ -0.957e-8■■■■■ 27.4
NOLC1Q14978 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.537e-8■■■■■ 27.4
NOLC1Q14978 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.619e-14■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.069e-14■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 LSM4-206ENST00000600289 1113 ntTSL 217.71■□□□□ 0.439e-14■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 GRHPR-204ENST00000480596 1893 ntTSL 220.77■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 GRHPR-209ENST00000494290 1593 ntTSL 516.15■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 GRHPR-210ENST00000497693 4762 ntTSL 214.77□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.782e-69■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 RPL3-203ENST00000402527 1205 ntTSL 519.91■□□□□ 0.782e-69■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 RPL3-211ENST00000465618 2108 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.132e-69■■■■■ 27.3
NOLC1Q14978 SNHG14-203ENST00000424333 2097 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.295e-9■■■■■ 27.2
NOLC1Q14978 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.15e-9■■■■■ 27.2
NOLC1Q14978 SNHG14-202ENST00000424208 3166 ntTSL 512.73□□□□□ -0.375e-9■■■■■ 27.2
NOLC1Q14978 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.585e-9■■■■■ 27.2
NOLC1Q14978 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.785e-9■■■■■ 27.2
NOLC1Q14978 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.365e-9■■■■■ 27.2
NOLC1Q14978 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 27.2
NOLC1Q14978 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 27.2
NOLC1Q14978 RPL3-212ENST00000467105 1396 ntTSL 1 (best)15.46■□□□□ 0.074e-69■■■■■ 27.1
NOLC1Q14978 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.975e-8■■■■■ 27
NOLC1Q14978 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 519.83■□□□□ 0.774e-9■■■■■ 27
NOLC1Q14978 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.424e-9■■■■■ 27
NOLC1Q14978 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.424e-9■■■■■ 27
NOLC1Q14978 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 26.96□□□□□ -1.35e-82■■■■■ 27
NOLC1Q14978 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 26.9□□□□□ -1.35e-82■■■■■ 27
NOLC1Q14978 PSMA6-205ENST00000554457 4730 nt8.18□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 27
NOLC1Q14978 PSMA6-213ENST00000556221 423 ntTSL 34.52□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 27
NOLC1Q14978 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.54e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-203ENST00000420199 1002 ntTSL 316.73■□□□□ 0.274e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 515.69■□□□□ 0.14e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 215.22■□□□□ 0.034e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.154e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 313.28□□□□□ -0.284e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 213.24□□□□□ -0.294e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-212ENST00000589187 568 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 212.67□□□□□ -0.384e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-202ENST00000414002 430 ntTSL 210.66□□□□□ -0.74e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 29.6□□□□□ -0.874e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.964e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 58.84□□□□□ -0.994e-70■■■■■ 26.9
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NOLC1Q14978 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.334e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.384e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 56.43□□□□□ -1.384e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNHG5-205ENST00000427501 680 ntTSL 25.31□□□□□ -1.564e-70■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.32e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.242e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-218ENST00000515752 1809 ntTSL 517.35■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-203ENST00000503674 2426 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-216ENST00000514027 2209 ntTSL 214.66□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-208ENST00000507522 644 ntTSL 513.43□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-211ENST00000509564 630 ntTSL 313.22□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-219ENST00000515815 704 ntTSL 313.22□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-209ENST00000509082 434 ntTSL 513.22□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SDHA-214ENST00000511810 3001 ntTSL 211.56□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.161e-323■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.131e-323■■■■■ 26.9
NOLC1Q14978 UGDH-207ENST00000509391 577 ntTSL 317.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 26.8
NOLC1Q14978 UGDH-203ENST00000503779 575 ntTSL 417.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 26.8
NOLC1Q14978 UGDH-210ENST00000514106 568 ntTSL 417.5■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 26.8
NOLC1Q14978 UGDH-212ENST00000515398 584 ntTSL 517.5■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 26.8
NOLC1Q14978 UGDH-209ENST00000510881 549 ntTSL 36.58□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 26.8
NOLC1Q14978 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-18■■■■□ 26.7
NOLC1Q14978 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-11■■■■□ 26.7
NOLC1Q14978 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.652e-8■■■■□ 26.7
NOLC1Q14978 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-8■■■■□ 26.7
NOLC1Q14978 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.111e-19■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-19■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.031e-19■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.076e-9■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.746e-9■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.746e-9■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.846e-9■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 49.09□□□□□ -0.956e-9■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.186e-9■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.26e-9■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 47.28□□□□□ -1.246e-9■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 MCCC2-208ENST00000512218 2127 ntTSL 218.83■□□□□ 0.612e-7■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 ACSF3-212ENST00000541755 477 ntTSL 518.1■□□□□ 0.492e-7■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 26.6
NOLC1Q14978 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-9■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-9■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 COX7C-204ENST00000510447 581 ntTSL 311.83□□□□□ -0.527e-31■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.657e-31■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.657e-31■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.047e-31■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 COX7C-206ENST00000513124 693 ntTSL 55.83□□□□□ -1.487e-31■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 34.88□□□□□ -1.637e-31■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 24.87□□□□□ -1.637e-31■■■■□ 26.5
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