Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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