Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMQ13315 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMQ13315 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMQ13315 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMQ13315 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMQ13315 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMQ13315 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMQ13315 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMQ13315 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMQ13315 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMQ13315 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMQ13315 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMQ13315 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMQ13315 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMQ13315 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMQ13315 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMQ13315 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMQ13315 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMQ13315 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMQ13315 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMQ13315 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATMQ13315 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATMQ13315 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATMQ13315 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATMQ13315 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATMQ13315 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATMQ13315 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATMQ13315 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATMQ13315 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATMQ13315 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATMQ13315 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATMQ13315 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATMQ13315 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATMQ13315 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATMQ13315 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATMQ13315 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATMQ13315 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATMQ13315 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATMQ13315 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATMQ13315 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATMQ13315 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATMQ13315 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATMQ13315 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATMQ13315 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATMQ13315 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATMQ13315 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATMQ13315 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATMQ13315 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATMQ13315 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATMQ13315 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATMQ13315 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATMQ13315 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATMQ13315 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATMQ13315 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATMQ13315 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATMQ13315 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATMQ13315 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATMQ13315 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATMQ13315 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATMQ13315 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATMQ13315 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATMQ13315 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATMQ13315 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATMQ13315 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATMQ13315 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATMQ13315 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATMQ13315 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATMQ13315 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATMQ13315 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATMQ13315 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATMQ13315 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATMQ13315 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATMQ13315 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATMQ13315 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATMQ13315 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATMQ13315 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATMQ13315 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATMQ13315 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATMQ13315 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMQ13315 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMQ13315 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMQ13315 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMQ13315 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMQ13315 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMQ13315 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
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