Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300CQ08708 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD300CQ08708 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CD300CQ08708 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD300CQ08708 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD300CQ08708 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD300CQ08708 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD300CQ08708 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD300CQ08708 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD300CQ08708 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD300CQ08708 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD300CQ08708 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD300CQ08708 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD300CQ08708 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD300CQ08708 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD300CQ08708 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD300CQ08708 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD300CQ08708 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD300CQ08708 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD300CQ08708 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD300CQ08708 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD300CQ08708 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms