Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO1P63165 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SUMO1P63165 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO1P63165 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms