Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB10P61026 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB10P61026 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB10P61026 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB10P61026 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB10P61026 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB10P61026 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB10P61026 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB10P61026 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB10P61026 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB10P61026 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB10P61026 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB10P61026 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB10P61026 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB10P61026 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB10P61026 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB10P61026 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB10P61026 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB10P61026 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB10P61026 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB10P61026 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB10P61026 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB10P61026 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB10P61026 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB10P61026 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB10P61026 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB10P61026 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB10P61026 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB10P61026 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB10P61026 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB10P61026 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB10P61026 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB10P61026 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB10P61026 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB10P61026 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB10P61026 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB10P61026 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB10P61026 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB10P61026 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB10P61026 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB10P61026 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB10P61026 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB10P61026 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB10P61026 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB10P61026 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB10P61026 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB10P61026 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB10P61026 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB10P61026 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms