Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAG2P55895 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAG2P55895 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAG2P55895 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAG2P55895 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAG2P55895 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAG2P55895 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAG2P55895 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAG2P55895 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAG2P55895 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAG2P55895 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAG2P55895 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAG2P55895 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAG2P55895 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAG2P55895 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAG2P55895 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAG2P55895 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAG2P55895 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAG2P55895 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAG2P55895 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAG2P55895 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAG2P55895 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAG2P55895 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAG2P55895 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAG2P55895 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAG2P55895 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAG2P55895 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAG2P55895 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAG2P55895 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAG2P55895 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAG2P55895 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAG2P55895 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAG2P55895 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAG2P55895 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAG2P55895 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAG2P55895 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAG2P55895 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAG2P55895 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAG2P55895 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAG2P55895 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAG2P55895 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAG2P55895 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAG2P55895 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAG2P55895 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAG2P55895 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAG2P55895 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAG2P55895 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAG2P55895 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAG2P55895 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAG2P55895 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAG2P55895 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAG2P55895 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAG2P55895 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAG2P55895 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAG2P55895 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAG2P55895 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAG2P55895 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAG2P55895 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAG2P55895 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAG2P55895 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAG2P55895 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAG2P55895 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAG2P55895 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAG2P55895 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAG2P55895 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAG2P55895 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAG2P55895 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAG2P55895 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms