Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKI67P46013 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKI67P46013 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKI67P46013 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKI67P46013 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKI67P46013 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKI67P46013 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKI67P46013 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKI67P46013 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKI67P46013 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKI67P46013 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKI67P46013 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKI67P46013 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
MKI67P46013 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKI67P46013 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKI67P46013 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKI67P46013 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKI67P46013 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKI67P46013 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKI67P46013 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKI67P46013 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MKI67P46013 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKI67P46013 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MKI67P46013 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MKI67P46013 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKI67P46013 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKI67P46013 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKI67P46013 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKI67P46013 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKI67P46013 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKI67P46013 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKI67P46013 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKI67P46013 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKI67P46013 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKI67P46013 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKI67P46013 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MKI67P46013 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKI67P46013 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MKI67P46013 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MKI67P46013 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKI67P46013 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKI67P46013 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKI67P46013 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKI67P46013 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKI67P46013 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKI67P46013 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKI67P46013 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKI67P46013 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKI67P46013 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MKI67P46013 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKI67P46013 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKI67P46013 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKI67P46013 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MKI67P46013 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MKI67P46013 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKI67P46013 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKI67P46013 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKI67P46013 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKI67P46013 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKI67P46013 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKI67P46013 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKI67P46013 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKI67P46013 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKI67P46013 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKI67P46013 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKI67P46013 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKI67P46013 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKI67P46013 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKI67P46013 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKI67P46013 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKI67P46013 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKI67P46013 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MKI67P46013 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKI67P46013 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKI67P46013 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKI67P46013 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKI67P46013 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MKI67P46013 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MKI67P46013 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MKI67P46013 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MKI67P46013 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKI67P46013 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKI67P46013 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKI67P46013 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKI67P46013 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKI67P46013 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKI67P46013 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKI67P46013 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKI67P46013 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKI67P46013 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MKI67P46013 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MKI67P46013 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms