Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX19P40855 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX19P40855 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX19P40855 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX19P40855 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX19P40855 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX19P40855 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX19P40855 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX19P40855 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX19P40855 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX19P40855 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX19P40855 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX19P40855 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX19P40855 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX19P40855 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX19P40855 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX19P40855 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX19P40855 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX19P40855 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX19P40855 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX19P40855 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX19P40855 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX19P40855 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX19P40855 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX19P40855 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX19P40855 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX19P40855 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX19P40855 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX19P40855 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX19P40855 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX19P40855 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX19P40855 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX19P40855 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX19P40855 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX19P40855 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX19P40855 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX19P40855 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX19P40855 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX19P40855 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX19P40855 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX19P40855 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX19P40855 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX19P40855 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX19P40855 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX19P40855 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX19P40855 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX19P40855 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX19P40855 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX19P40855 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX19P40855 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX19P40855 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX19P40855 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX19P40855 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX19P40855 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX19P40855 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX19P40855 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX19P40855 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX19P40855 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX19P40855 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX19P40855 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX19P40855 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX19P40855 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX19P40855 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX19P40855 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX19P40855 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX19P40855 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX19P40855 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX19P40855 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX19P40855 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX19P40855 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX19P40855 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX19P40855 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX19P40855 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX19P40855 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX19P40855 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX19P40855 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX19P40855 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX19P40855 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX19P40855 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX19P40855 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX19P40855 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX19P40855 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX19P40855 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms