Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BGNP21810 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BGNP21810 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BGNP21810 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BGNP21810 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BGNP21810 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BGNP21810 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BGNP21810 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BGNP21810 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BGNP21810 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BGNP21810 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BGNP21810 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BGNP21810 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BGNP21810 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BGNP21810 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BGNP21810 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BGNP21810 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BGNP21810 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BGNP21810 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BGNP21810 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BGNP21810 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BGNP21810 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BGNP21810 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BGNP21810 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BGNP21810 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BGNP21810 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BGNP21810 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BGNP21810 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BGNP21810 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BGNP21810 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BGNP21810 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BGNP21810 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BGNP21810 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BGNP21810 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BGNP21810 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BGNP21810 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BGNP21810 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BGNP21810 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BGNP21810 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BGNP21810 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BGNP21810 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BGNP21810 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BGNP21810 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BGNP21810 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BGNP21810 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BGNP21810 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BGNP21810 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BGNP21810 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BGNP21810 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BGNP21810 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BGNP21810 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BGNP21810 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BGNP21810 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BGNP21810 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BGNP21810 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BGNP21810 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BGNP21810 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BGNP21810 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BGNP21810 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BGNP21810 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BGNP21810 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BGNP21810 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BGNP21810 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BGNP21810 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BGNP21810 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BGNP21810 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BGNP21810 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BGNP21810 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BGNP21810 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BGNP21810 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BGNP21810 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BGNP21810 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BGNP21810 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BGNP21810 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BGNP21810 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BGNP21810 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BGNP21810 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BGNP21810 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BGNP21810 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BGNP21810 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BGNP21810 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BGNP21810 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BGNP21810 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BGNP21810 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BGNP21810 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BGNP21810 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BGNP21810 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BGNP21810 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BGNP21810 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BGNP21810 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms