Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE6GP18545 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms