Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA4P13612 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGA4P13612 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA4P13612 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms