Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM13P0DJ93 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM13P0DJ93 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms