Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB1P08034 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB1P08034 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB1P08034 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB1P08034 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB1P08034 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB1P08034 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB1P08034 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB1P08034 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB1P08034 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB1P08034 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB1P08034 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB1P08034 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB1P08034 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB1P08034 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB1P08034 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB1P08034 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB1P08034 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB1P08034 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB1P08034 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB1P08034 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB1P08034 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB1P08034 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB1P08034 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB1P08034 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB1P08034 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB1P08034 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB1P08034 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB1P08034 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB1P08034 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB1P08034 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB1P08034 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB1P08034 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB1P08034 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB1P08034 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB1P08034 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB1P08034 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB1P08034 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB1P08034 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB1P08034 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB1P08034 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB1P08034 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB1P08034 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB1P08034 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GJB1P08034 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GJB1P08034 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB1P08034 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB1P08034 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB1P08034 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB1P08034 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB1P08034 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB1P08034 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB1P08034 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB1P08034 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB1P08034 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB1P08034 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB1P08034 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB1P08034 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB1P08034 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJB1P08034 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB1P08034 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB1P08034 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB1P08034 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB1P08034 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB1P08034 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB1P08034 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB1P08034 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB1P08034 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB1P08034 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB1P08034 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB1P08034 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB1P08034 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB1P08034 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB1P08034 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB1P08034 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB1P08034 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB1P08034 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJB1P08034 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJB1P08034 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms