Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAF1P04049 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAF1P04049 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAF1P04049 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAF1P04049 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAF1P04049 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAF1P04049 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAF1P04049 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAF1P04049 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAF1P04049 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAF1P04049 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAF1P04049 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAF1P04049 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAF1P04049 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAF1P04049 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAF1P04049 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAF1P04049 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAF1P04049 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAF1P04049 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAF1P04049 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAF1P04049 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAF1P04049 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAF1P04049 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAF1P04049 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAF1P04049 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAF1P04049 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAF1P04049 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAF1P04049 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAF1P04049 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAF1P04049 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAF1P04049 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAF1P04049 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAF1P04049 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAF1P04049 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAF1P04049 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAF1P04049 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAF1P04049 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAF1P04049 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAF1P04049 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAF1P04049 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAF1P04049 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAF1P04049 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAF1P04049 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAF1P04049 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAF1P04049 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAF1P04049 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAF1P04049 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAF1P04049 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAF1P04049 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAF1P04049 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAF1P04049 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAF1P04049 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAF1P04049 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAF1P04049 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAF1P04049 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAF1P04049 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAF1P04049 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAF1P04049 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAF1P04049 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAF1P04049 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAF1P04049 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAF1P04049 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAF1P04049 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAF1P04049 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAF1P04049 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAF1P04049 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAF1P04049 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAF1P04049 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAF1P04049 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAF1P04049 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAF1P04049 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms