Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTAP01040 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTAP01040 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTAP01040 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSTAP01040 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTAP01040 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTAP01040 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTAP01040 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSTAP01040 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTAP01040 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTAP01040 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTAP01040 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTAP01040 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTAP01040 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSTAP01040 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTAP01040 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTAP01040 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTAP01040 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTAP01040 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTAP01040 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTAP01040 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTAP01040 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSTAP01040 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSTAP01040 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTAP01040 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTAP01040 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTAP01040 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTAP01040 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTAP01040 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTAP01040 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTAP01040 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTAP01040 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTAP01040 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTAP01040 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTAP01040 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTAP01040 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTAP01040 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTAP01040 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTAP01040 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTAP01040 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTAP01040 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTAP01040 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTAP01040 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTAP01040 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTAP01040 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTAP01040 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTAP01040 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTAP01040 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTAP01040 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTAP01040 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTAP01040 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTAP01040 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTAP01040 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTAP01040 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTAP01040 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTAP01040 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTAP01040 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTAP01040 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTAP01040 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTAP01040 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTAP01040 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTAP01040 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTAP01040 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTAP01040 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTAP01040 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTAP01040 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTAP01040 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTAP01040 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTAP01040 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTAP01040 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTAP01040 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTAP01040 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTAP01040 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTAP01040 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTAP01040 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTAP01040 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTAP01040 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTAP01040 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTAP01040 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTAP01040 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTAP01040 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTAP01040 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTAP01040 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTAP01040 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTAP01040 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTAP01040 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTAP01040 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSTAP01040 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTAP01040 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTAP01040 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTAP01040 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 973.7 ms