Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTDNEP1O95476 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTDNEP1O95476 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTDNEP1O95476 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTDNEP1O95476 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1O95476 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms