Protein–RNA interactions for Protein: O95379

TNFAIP8, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8O95379 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8O95379 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8O95379 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8O95379 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8O95379 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8O95379 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8O95379 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFAIP8O95379 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFAIP8O95379 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8O95379 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8O95379 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFAIP8O95379 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244 ms