Protein–RNA interactions for Protein: O15480

MAGEB3, Melanoma-associated antigen B3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEB3O15480 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEB3O15480 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEB3O15480 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEB3O15480 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms