Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDC80O14777 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDC80O14777 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDC80O14777 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDC80O14777 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDC80O14777 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDC80O14777 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NDC80O14777 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDC80O14777 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDC80O14777 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC80O14777 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC80O14777 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC80O14777 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC80O14777 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC80O14777 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC80O14777 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDC80O14777 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDC80O14777 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDC80O14777 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDC80O14777 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDC80O14777 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDC80O14777 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDC80O14777 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDC80O14777 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDC80O14777 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDC80O14777 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDC80O14777 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDC80O14777 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDC80O14777 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDC80O14777 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDC80O14777 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDC80O14777 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDC80O14777 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDC80O14777 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDC80O14777 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDC80O14777 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC80O14777 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC80O14777 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC80O14777 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC80O14777 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDC80O14777 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC80O14777 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC80O14777 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC80O14777 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDC80O14777 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDC80O14777 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDC80O14777 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDC80O14777 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDC80O14777 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDC80O14777 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC80O14777 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC80O14777 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC80O14777 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC80O14777 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC80O14777 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC80O14777 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDC80O14777 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDC80O14777 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDC80O14777 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC80O14777 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC80O14777 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC80O14777 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC80O14777 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC80O14777 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NDC80O14777 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC80O14777 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC80O14777 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC80O14777 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC80O14777 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDC80O14777 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC80O14777 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC80O14777 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC80O14777 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC80O14777 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC80O14777 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC80O14777 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDC80O14777 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC80O14777 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms